DPU har et omfattende samarbejde med statslige, regionale og kommunale myndigheder. Samarbejdet spreder sig over en lang række forskellige opgavetyper og omfatter bl.a.:
Også internationalt indgår forskere fra DPU i samarbejder med nationale myndigheder. DPU-forskere har bl.a. arbejdet med og for myndigheder i Norge, Sverige, Schweiz og Vietnam.
DPU bidrager blandt andet i Rådet for Børns Læring og Handicaprådet.
Desuden har en række DPU-forskere medvirket til fagbeskrivelserne knyttet til folkeskolereformen fra 2014.
DPU er Danmarks repræsentant i den internationale organisation for uddannelsesforskning IEA. DPU gennemfører en række internationale sammenlignende undersøgelser i samarbejde med Undervisningsministeriet:
DPU har ligeledes deltaget i de internationale PISA-undersøgelser i et samarbejde med VIVE og Danmarks Statistik, finansieret af Undervisningsministeriet.
DPU har vundet en lang række projekter i udbud, heriblandt udviklings- og inspirationsprojekter, der resulterer i videns- og praksisbaserede anbefalinger.
DPU gennemfører og bidrager til evaluering og følgeforskning af forskellige indsatser bl.a. for regionerne.
DPU gennemfører rekvirerede aktionsforsknings- og aktionslæringsprojekter i samarbejde med eksempelvis kommunale daginstitutioner, dagplejer og skoler.
DPU samarbejder blandt andet med professionshøjskolerne, EVA og forskere fra andre universiteter.